Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPCQ01831 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPCQ01831 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPCQ01831 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPCQ01831 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPCQ01831 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
XPCQ01831 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
XPCQ01831 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
XPCQ01831 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
XPCQ01831 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XPCQ01831 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XPCQ01831 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
XPCQ01831 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XPCQ01831 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
XPCQ01831 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
XPCQ01831 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
XPCQ01831 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
XPCQ01831 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
XPCQ01831 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
XPCQ01831 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XPCQ01831 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XPCQ01831 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XPCQ01831 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
XPCQ01831 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XPCQ01831 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
XPCQ01831 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
XPCQ01831 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XPCQ01831 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XPCQ01831 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
XPCQ01831 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
XPCQ01831 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XPCQ01831 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
XPCQ01831 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
XPCQ01831 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
XPCQ01831 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XPCQ01831 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
XPCQ01831 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
XPCQ01831 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
XPCQ01831 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
XPCQ01831 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms