Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PRCDQ00LT1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PRCDQ00LT1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms