Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CDK5Q00535 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CDK5Q00535 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms