Protein–RNA interactions for Protein: P82251

SLC7A9, b(0,+)-type amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A9P82251 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SLC7A9P82251 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC7A9P82251 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms