Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IRX1P78414 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IRX1P78414 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IRX1P78414 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IRX1P78414 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IRX1P78414 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRX1P78414 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRX1P78414 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRX1P78414 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRX1P78414 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRX1P78414 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRX1P78414 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRX1P78414 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IRX1P78414 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms