Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSNK2A1P68400 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms