Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TUBB4BP68371 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBB4BP68371 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms