Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VAMP2P63027 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
VAMP2P63027 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms