Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOAP61586 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOAP61586 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RHOAP61586 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RHOAP61586 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RHOAP61586 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RHOAP61586 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RHOAP61586 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RHOAP61586 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RHOAP61586 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RHOAP61586 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 467.5 ms