Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB15P59190 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB15P59190 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB15P59190 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB15P59190 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB15P59190 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB15P59190 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB15P59190 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB15P59190 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB15P59190 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB15P59190 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB15P59190 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB15P59190 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB15P59190 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB15P59190 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB15P59190 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB15P59190 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB15P59190 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB15P59190 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB15P59190 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB15P59190 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB15P59190 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB15P59190 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB15P59190 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms