Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00315P59091 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00315P59091 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00315P59091 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00315P59091 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00315P59091 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00315P59091 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00315P59091 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00315P59091 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms