Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RHBDL3P58872 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RHBDL3P58872 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms