Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
NUP107P57740 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
NUP107P57740 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
NUP107P57740 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
NUP107P57740 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
NUP107P57740 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms