Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HDAC4P56524 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC4P56524 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms