Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CACNB3P54284 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNB3P54284 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms