Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARFIP2P53365 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARFIP2P53365 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms