Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LUMP51884 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LUMP51884 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LUMP51884 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LUMP51884 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LUMP51884 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LUMP51884 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LUMP51884 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LUMP51884 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LUMP51884 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LUMP51884 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms