Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSEN2P49810 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSEN2P49810 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms