Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP4P49662 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP4P49662 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP4P49662 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP4P49662 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP4P49662 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP4P49662 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP4P49662 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CASP4P49662 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP4P49662 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP4P49662 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP4P49662 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP4P49662 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP4P49662 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CASP4P49662 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CASP4P49662 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CASP4P49662 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CASP4P49662 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CASP4P49662 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CASP4P49662 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms