Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HOXA1P49639 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
HOXA1P49639 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms