Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LMAN1P49257 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms