Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LSSP48449 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LSSP48449 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LSSP48449 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LSSP48449 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LSSP48449 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSSP48449 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSSP48449 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LSSP48449 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LSSP48449 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms