Protein–RNA interactions for Protein: P47870

GABRB2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB2P47870 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB2P47870 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB2P47870 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms