Protein–RNA interactions for Protein: P47095

MDE1, Methylthioribulose-1-phosphate dehydratase, yeastyeast

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MDE1P47095 YEA4YEL004W 1029 nt3.01□□□□□ -1.93
MDE1P47095 NSA2YER126C 786 nt3.01□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YKL091CYKL091C 933 nt3.01□□□□□ -1.93
MDE1P47095 RPS30AYLR287C-A 192 nt3.01□□□□□ -1.93
MDE1P47095 MPD2YOL088C 834 nt3.01□□□□□ -1.93
MDE1P47095 MCA1YOR197W 1299 nt3.01□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YBR287WYBR287W 1284 nt3.01□□□□□ -1.93
MDE1P47095 IKI3YLR384C 4050 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 MSH4YFL003C 2637 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YGR160WYGR160W 612 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 GTR2YGR163W 1026 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 CTK2YJL006C 972 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YJL032WYJL032W 315 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 SUB1YMR039C 879 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 RPL20AYMR242C 519 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 RCE1YMR274C 948 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 TSR4YOL022C 1227 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 SYO1YDL063C 1863 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 MET5YJR137C 4329 nt3□□□□□ -1.93
MDE1P47095 RGR1YLR071C 3249 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 KRE2YDR483W 1329 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 COBQ0105 1158 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 RPL22AYLR061W 366 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 INP1YMR204C 1263 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YNL043CYNL043C 321 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 SPR2YOR214C 711 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 SRL1YOR247W 633 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 MRS2YOR334W 1413 nt2.99□□□□□ -1.93
MDE1P47095 SPO14YKR031C 5052 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 DYN1YKR054C 12279 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 MIX14YDR031W 366 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YGL159WYGL159W 1113 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 NNF1YJR112W 606 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 MIC27YNL100W 705 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 RPL20BYOR312C 519 nt2.98□□□□□ -1.93
MDE1P47095 APM3YBR288C 1452 nt2.97□□□□□ -1.93
MDE1P47095 GPX1YKL026C 504 nt2.97□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YLR230WYLR230W 306 nt2.97□□□□□ -1.93
MDE1P47095 IMP4YNL075W 873 nt2.97□□□□□ -1.93
MDE1P47095 MGE1YOR232W 687 nt2.97□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.97□□□□□ -1.93
MDE1P47095 RFC5YBR087W 1065 nt2.97□□□□□ -1.93
MDE1P47095 TIM12YBR091C 330 nt2.97□□□□□ -1.93
MDE1P47095 CHO2YGR157W 2610 nt2.97□□□□□ -1.93
MDE1P47095 YDR061WYDR061W 1620 nt2.97□□□□□ -1.93
MDE1P47095 ERP3YDL018C 678 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 ATC1YDR184C 885 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 STE2YFL026W 1296 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 PEF1YGR058W 1008 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 UPF3YGR072W 1164 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YIL175WYIL175W 318 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 ATP11YNL315C 957 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 SME1YOR159C 285 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YBR090CYBR090C 369 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 UBP14YBR058C 2346 nt2.96□□□□□ -1.94
MDE1P47095 VPS30YPL120W 1674 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 POM152YMR129W 4014 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 AI3Q0060 1248 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 UBC5YDR059C 447 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 TVP15YDR100W 432 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 HPA3YEL066W 540 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 MAM1YER106W 909 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 MIG2YGL209W 1149 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 TCD1YHR003C 1290 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YJL169WYJL169W 369 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 SEC14YMR079W 915 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 ERG29YMR134W 714 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 RRD2YPL152W 1077 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 CWC22YGR278W 1734 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 STN1YDR082W 1485 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 SSN2YDR443C 4263 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 DBP7YKR024C 2229 nt2.95□□□□□ -1.94
MDE1P47095 AVT2YEL064C 1443 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 BOI1YBL085W 2943 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 MDM36YPR083W 1740 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YPD1YDL235C 504 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 MFA1YDR461W 111 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 YHL044WYHL044W 708 nt2.94□□□□□ -1.94
MDE1P47095 RCN1YKL159C 636 nt2.94□□□□□ -1.94
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