Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CDKN1BP46527 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms