Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
ATRXP46100 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
ATRXP46100 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
ATRXP46100 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRXP46100 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRXP46100 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRXP46100 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRXP46100 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRXP46100 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRXP46100 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRXP46100 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRXP46100 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
ATRXP46100 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
ATRXP46100 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ATRXP46100 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms