Protein–RNA interactions for Protein: P43115

PTGER3, Prostaglandin E2 receptor EP3 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER3P43115 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PTGER3P43115 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGER3P43115 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTGER3P43115 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PTGER3P43115 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PTGER3P43115 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PTGER3P43115 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PTGER3P43115 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PTGER3P43115 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PTGER3P43115 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PTGER3P43115 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PTGER3P43115 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms