Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MLH1P40692 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MLH1P40692 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MLH1P40692 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MLH1P40692 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MLH1P40692 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MLH1P40692 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MLH1P40692 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MLH1P40692 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MLH1P40692 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MLH1P40692 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MLH1P40692 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms