Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PPARGP37231 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PPARGP37231 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPARGP37231 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPARGP37231 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PPARGP37231 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PPARGP37231 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PPARGP37231 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PPARGP37231 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PPARGP37231 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms