Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXD13P35453 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD13P35453 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms