Protein–RNA interactions for Protein: P33552

CKS2, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKS2P33552 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKS2P33552 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKS2P33552 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKS2P33552 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKS2P33552 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CKS2P33552 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS2P33552 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS2P33552 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS2P33552 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS2P33552 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS2P33552 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS2P33552 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS2P33552 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS2P33552 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS2P33552 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms