Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CCKARP32238 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCKARP32238 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCKARP32238 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCKARP32238 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms