Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXC12P31275 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXC12P31275 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms