Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PTX3P26022 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTX3P26022 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTX3P26022 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTX3P26022 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTX3P26022 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTX3P26022 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTX3P26022 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTX3P26022 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTX3P26022 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTX3P26022 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTX3P26022 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTX3P26022 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTX3P26022 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTX3P26022 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTX3P26022 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTX3P26022 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms