Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ITGA3P26006 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ITGA3P26006 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms