Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LMO2P25791 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LMO2P25791 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LMO2P25791 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LMO2P25791 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LMO2P25791 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LMO2P25791 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LMO2P25791 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO2P25791 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO2P25791 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO2P25791 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO2P25791 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO2P25791 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LMO2P25791 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms