Protein–RNA interactions for Protein: P25441

RPC53, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, yeast

Predictions only

Length 422 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC53	P25441	UNG1	YML021C	1080 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	RIM9	YMR063W	720 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	MER1	YNL210W	813 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	YBR116C	YBR116C	528 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	SWD3	YBR175W	948 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	YDR210W-B	YDR210W-B	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	YDR261W-B	YDR261W-B	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	YFL002W-A	YFL002W-A	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	YGR161W-B	YGR161W-B	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	YLR410W-B	YLR410W-B	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	YCL019W	YCL019W	5313 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	KHA1	YJL094C	2622 nt		3.23	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	YCK2	YNL154C	1641 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	GIS4	YML006C	2325 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	URB2	YJR041C	3525 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	PSK1	YAL017W	4071 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	VAS1	YGR094W	3315 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	YER165C-A	YER165C-A	357 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	VMA10	YHR039C-A	345 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	PPX1	YHR201C	1194 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	POL32	YJR043C	1053 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	YLR339C	YLR339C	552 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	PDS5	YMR076C	3834 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	DIM1	YPL266W	957 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	snR35	snR35	204 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	TAF2	YCR042C	4224 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	GCD6	YDR211W	2139 nt		3.22	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	TLC1	TLC1	1301 nt		3.21	□□□□□ -1.89
RPC53	P25441	SKO1	YNL167C	1944 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	PDC2	YDR081C	2778 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YKL100C	YKL100C	1764 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	RMT2	YDR465C	1239 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	RPL23B	YER117W	414 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	OST5	YGL226C-A	261 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	QCR10	YHR001W-A	234 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YHR212C	YHR212C	336 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YJL032W	YJL032W	315 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YJL169W	YJL169W	369 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YKL091C	YKL091C	933 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YKR070W	YKR070W	1059 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YAR060C	YAR060C	336 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	PRM6	YML047C	1059 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	RPL6A	YML073C	531 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YNL203C	YNL203C	612 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YOL106W	YOL106W	354 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	RPL20B	YOR312C	519 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	PEX34	YCL056C	435 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YJL049W	YJL049W	1353 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	RRM3	YHR031C	2172 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	AEP1	YMR064W	1557 nt		3.21	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	VPS33	YLR396C	2076 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	MED1	YPR070W	1701 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	HMO1	YDR174W	741 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	PIB1	YDR313C	861 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YKL070W	YKL070W	510 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	FAR3	YMR052W	615 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	PDR17	YNL264C	1053 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	SPT14	YPL175W	1359 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	AI2	Q0055	2565 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	MET5	YJR137C	4329 nt		3.2	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	KAP104	YBR017C	2757 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	MIX14	YDR031W	366 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YDR442W	YDR442W	393 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YER066C-A	YER066C-A	501 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	GTR2	YGR163W	1026 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YKL033W-A	YKL033W-A	711 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	MRPL38	YKL170W	417 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	COX14	YML129C	213 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	MPD2	YOL088C	834 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	DCP1	YOL149W	696 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	KAR4	YCL055W	1008 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	NOP56	YLR197W	1515 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YLR446W	YLR446W	1302 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	ESA1	YOR244W	1338 nt		3.19	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	PMR1	YGL167C	2853 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	FAR1	YJL157C	2493 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	MSH4	YFL003C	2637 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	HMF1	YER057C	390 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	GEP7	YGL057C	864 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YGL159W	YGL159W	1113 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YIL141W	YIL141W	390 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YLR297W	YLR297W	390 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	SRT1	YMR101C	1032 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YOR097C	YOR097C	528 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	TAO3	YIL129C	7131 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	RCY1	YJL204C	2523 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YIL169C	YIL169C	2988 nt		3.18	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	HOP1	YIL072W	1818 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YDL157C	YDL157C	357 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	CPR5	YDR304C	678 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	FSH1	YHR049W	732 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	DSE2	YHR143W	978 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	GPX1	YKL026C	504 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YLR169W	YLR169W	354 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	VMA6	YLR447C	1038 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	SEC14	YMR079W	915 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	RPS12	YOR369C	432 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	YPL107W	YPL107W	747 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	AIM4	YBR194W	372 nt		3.17	□□□□□ -1.9
RPC53	P25441	SRP1	YNL189W	1629 nt		3.17	□□□□□ -1.9

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