Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCNE1P24864 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNE1P24864 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.6 ms