Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
VAMP1P23763 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms