Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EIF4BP23588 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EIF4BP23588 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms