Protein–RNA interactions for Protein: P23560

BDNF, Brain-derived neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDNFP23560 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BDNFP23560 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
BDNFP23560 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BDNFP23560 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
BDNFP23560 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BDNFP23560 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BDNFP23560 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BDNFP23560 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDNFP23560 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDNFP23560 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDNFP23560 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDNFP23560 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDNFP23560 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDNFP23560 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BDNFP23560 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BDNFP23560 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BDNFP23560 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BDNFP23560 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BDNFP23560 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms