Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TNFSF4P23510 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TNFSF4P23510 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms