Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GCSHP23434 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GCSHP23434 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
GCSHP23434 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
GCSHP23434 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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