Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME2P23368 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME2P23368 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME2P23368 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME2P23368 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME2P23368 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME2P23368 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ME2P23368 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ME2P23368 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ME2P23368 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ME2P23368 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ME2P23368 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ME2P23368 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ME2P23368 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ME2P23368 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ME2P23368 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms