Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CAPN3P20807 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms