Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
NTF3P20783 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
NTF3P20783 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NTF3P20783 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms