Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RAB4AP20338 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms