Protein–RNA interactions for Protein: P19623

SRM, Spermidine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRMP19623 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRMP19623 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRMP19623 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SRMP19623 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SRMP19623 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRMP19623 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRMP19623 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SRMP19623 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SRMP19623 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SRMP19623 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SRMP19623 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SRMP19623 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRMP19623 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRMP19623 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms