Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NCLP19338 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCLP19338 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCLP19338 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCLP19338 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCLP19338 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCLP19338 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCLP19338 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
NCLP19338 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NCLP19338 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NCLP19338 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms