Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATF6P18850 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF6P18850 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF6P18850 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF6P18850 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6P18850 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6P18850 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6P18850 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6P18850 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6P18850 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6P18850 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6P18850 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6P18850 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6P18850 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF6P18850 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF6P18850 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF6P18850 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATF6P18850 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATF6P18850 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF6P18850 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF6P18850 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF6P18850 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF6P18850 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF6P18850 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF6P18850 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms